植物是影響人工濕地凈化水體效能的關鍵因素之一，其可直接吸收利用水體中的營養物質促進自身生長，同時達到凈化水體的效果；植物根系為水體微生物提供良好的棲息場所，同時還可進行輸氧、泌氧從而創造好氧、厭氧的根際微環境。除此之外，植物在改善區域氣候，促進生態環境的良性循環，塑造良好景觀效果等方面發揮著不可替代的作用。

用于凈化水體的濕地植物類型豐富，對水體凈化機理也十分復雜，在考慮選擇人工濕地植物時，除了考慮植物本身對水體凈化的效能，還應考慮植物本身生長繁殖特性是否與濕地環境協調，從而維持濕地生態系統的穩定性。因此，科學、合理地選用濕地植物，是人工濕地系統建設與應用及維護的重要環節，在未來研究中，也是我們需要進行深入探索的重要課題。

未來，加強對濕地植物與濕地微生物的耦合作用，達到協同去除水體污染物的目的。水體污染物的去除主要是通過植物本身吸收、吸附和富集等以及根系微生物反應來共同完成的。研究表明，即使在大型水生植物大量存在的人工濕地中，微生物代謝作用凈化水體仍占主要地位。